云素材PPT模板超市 ChatGPT与PPT 2023-08-04

AI时代的弄潮儿：探索ChatGPT的最大化利益应用

文章主题：AI, 生命科学与AI, chatGPT

自人类基因组计划之后，生物学领域的数据量出现了爆炸式增长，这种数据增长的速度，使得研究已经很难再用传统的小工具进行分析。同时，得益于人工智能技术的发展，跨模态生物数据分析成为可能。从AlphaGo到AlphaFold，再到如今的ChatGPT

在当今这个AI技术或生成式AI得到广泛应用的时代，生命科学与AI的结合正呈现出前所未有的发展趋势。作为新时代的弄潮儿、开拓者或创新者，我们都在寻找如何将chatGPT这一强大工具发挥到极致，以实现自身利益的最大化。

一

Nature/Science连续刊文如何评价chatGPT？

作为一种AI语言模型，ChatGPT尚未成为任何已发表的科学或自然期刊研究的主题。然而，在国际顶级期刊《Nature》《Science》上已经有数篇论文讨论了其应用前景和学术伦理等问题。在最近的一项研究中，ChatGPT创建的摘要被提交给学术评审员，他们只发现了这些“假货”中的63%，这表明很多人工智能生成的文本很快就会进入文献当中。目前，大多数学术期刊是明文表示不接收chatGPT产生的文本。《Science》主编Holden Thorp认为ChatGPT很有趣但并不是一位合格的论文作者。多年来，《Science》系列期刊的作者已经签署了一份许可证以证明作品是原创的。对于科学期刊来说，“原创”这个词足以表明ChatGPT撰写的文本是不可接受的。为了明确起见，《Science》系列期刊现在正在更新许可和编辑政策，以规定ChatGPT（或任何其他AI工具）生成的文本、图形、图像不能在作品中使用，ChatGPT等人工智能程序不能是作者。违反这些政策将构成科学不端行为，与更改图像或抄袭现有作品没有什么不同。当然，有许多合法的数据集（不是论文的文本）是由人工智能在研究论文中有意生成的，而这些都不在这次变更范围之中。

二

生信人打开chatGPT的方式?

生信人该如何使用chatGPT，以下为大家梳理了几种对chatGPT承担生信相关工作的测试。（值得注意的是，目前国内网络IP暂时无妨访问和使用chatGPT，但生信工程师通过联系海外的朋友总能找到解决办法。）测试一：请介绍RNA测序分析流程处理数据的第一步是先要明确整个处理的workflow或pipeline是什么，对于最经典的RNA-seq数据，chatGPT似乎也已经了然于胸。

图1 测试二：如何可视化RNA测序的差异表达基因再进一步咨询可视化方面的细节，chatGPT给出了比较中肯的意见，火山图、热图、散点图甚至连GSEA都有一些提示。

图2测试三：请编写RNA测序分析的代码接下来测试代码能力，从原始测序reads定量到差异基因注释，chatGPT似乎也能给出代码，这可能就是程序猿担心失业的原因吧。

图3测试四：代码debug当进行到代码相关的debug时，chatGPT似乎也能一展身手，不仅告诉你代码哪里错了，还反馈错误的原因和修正之后的代码。（程序猿到这里才真的慌了）

图4测试五：肿瘤细胞PD1表达升高意味着什么

图5

三

小结

生命科学领域本身还存在很多没有被解决的重要任务，比如小分子-蛋白结合构象和亲和力预测、蛋白质设计等任务。目前看这些问题还没有被完美解决，如果chatGPT等人工智能算法在这些任务上取得突破，那么整个生命科学领域都会迎来巨大变化。参考文献：1.Thorp HH. ChatGPT is fun, but not an author. Science. 2023 Jan 27;379(6630):313. doi: 10.1126/science.adg7879. Epub 2023 Jan 26. PMID: 36701446.2.Else H. Abstracts written by ChatGPT fool scientists. Nature. 2023 Jan;613(7944):423. doi: 10.1038/d41586-023-00056-7. PMID: 36635510.

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